Soutenance de Thèse de David François

Dynamique spatiale et temporelle des communautés microbiennes dans les édifices hydrothermaux actifs

Venez nombreux à la soutenance de thèse de David François. Rendez-vous dans l'amphi A de l'IUEM Mercredi 17 Mars à 14 h

Résumé

Dans les sources hydrothermales océaniques profondes, le mélange du fluide hydrothermal chaud, acide et anoxique avec l’eau de mer froide et oxygénée provoque la formation de cheminées hydrothermales. Il s’agit de structures poreuses dont la composition minéralogique évolue au cours du temps. Les gradients thermiques et chimiques sont propices à la croissance de communautés microbiennes, qui présentent une forte diversité taxonomique, physiologique et métabolique. Malgré les nombreuses études portant sur la microbiologie de ces environnements, la dynamique spatiale et temporelle des communautés microbiennes des cheminées hydrothermales reste encore peu connue.  Notre étude a été basée sur un échantillonnage rigoureux de cheminées de six sites du champ hydrothermal Lucky Strike,  et du panache proximal associé. La composition minéralogique des cheminées hydrothermales, déterminée par diffraction aux rayons X, a permis d’estimer le stade de maturation des cheminées. Des approches complémentaires ont été mises en place pour étudier et comparer les communautés microbiennes des cheminées et du panache proximal. La diversité phylogénétique et la structure de ces communautés a été étudiée par une approche de metabarcoding, et des informations fonctionnelles ont été obtenues en réalisant des cultures en continu en bioréacteur, des enrichissements MPN ainsi que des mesures d’activité métabolique. Une souche appartenant au genre Persephonella a également été isolée et décrite et son adaptation a l’environnement hydrothermal a été montrée.